Banyaknya tangan-tangan jahil menjadikan Situs Goa Gong dipenuhi corat-coret (vandalisme) bahkan hampir semua sisi goa. Dari coretan cat, pilox bahkan langsung mengukir di bebatuan langsung.

Pembersihan ini dilakukan oleh Juru Pelihara Situs Goa Gong dan Staf Dinas Pariwisata dan Kebudayaan pada Selasa, 25 Agustus 2020.

Pembersihan vandalisme menggunakan media paint remover, sikat dan air. Uji coba pembersihan ini dilakukan di beberapa titik yaitu di depan goa dan dalam goa. Karena nantinya akan melihat reaksi paint remover tersebut jika di keadaan suhu yang berbeda (luar dan dalam goa). Untuk hasil pembersihan sendiri akan di cek berkala oleh Juru Pelihara dalam jangka waktu yang sudah ditentukan.